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?Frontiers in Oncology|彭吉潤、楊尹默課題組合作發(fā)表胰腺癌早期無創(chuàng)診斷新成果

發(fā)表日期:2025-03-18 來源:肝膽腫瘤外科 作者:劉亭亭 本頁責編:范曉,張潔
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3月10日,首都醫(yī)科大學附屬北京世紀壇醫(yī)院肝膽腫瘤外科彭吉潤教授課題組與北京大學第一醫(yī)院楊尹默教授課題組合作,在國際期刊Frontiers in Oncology上發(fā)表了題為Circulating cell-free DNA methylation analysis of pancreatic cancer patients for early noninvasive diagnosis的研究論文,填補了胰腺癌早期篩查和診斷領域空白,有望造福更多臨床患者。

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胰腺癌(PAC)是全球癌癥相關死亡的第七大原因,其早期癥狀隱匿且非特異,多數(shù)患者確診時已處于晚期,5年生存率僅為12%。目前,臨床上常用的胰腺癌診斷標志物CA19-9在疾病早期缺乏診斷敏感性和特異性。因此,迫切需要識別新的生物標志物或生物標志物組合,以解決胰腺癌早期篩查和診斷領域的空白。

該研究中,課題組收集了50例胰腺癌患者和52例健康對照者的血漿樣本,以及66例癌組織和配對正常胰腺組織樣本,采用甲基化CpG串聯(lián)擴增和測序(MCTA-Seq)方法對這些樣本進行檢測。MCTA-seq是彭吉潤教授課題組和北京大學生物醫(yī)學前沿創(chuàng)新中心湯富酬教授、黃巖誼教授和文路副研究員等合作建立的一種高通量平臺,能夠在一次實驗中對數(shù)千個“CGCGCGG”型高甲基化CpG島進行檢測,突破了制約高通量甲基化組學分析的技術瓶頸,其檢測下限可低至1-2個細胞的基因組DNA,因此極大地提高了檢測的靈敏度和準確性。

通過分析,研究人員在胰腺癌組織中篩選出4615個差異甲基化CpG位點,并在胰腺癌患者血漿中篩選出1323個高甲基化和2619個低甲基化CpG位點。其中,一些生物標志物如IRX4、PRKCB和CLEC11A已被識別為胰腺癌的潛在診斷指標,而MMP2、NAT8L和GFRA4等則是本研究新發(fā)現(xiàn)的潛在生物標志物。

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圖1 加和陽性法篩選胰腺癌診斷標志物,以及各個標志物在胰腺癌癌組織及配對正常組織中的差異表達情況。

從上述高甲基化CpG位點中,研究人員進一步采用機器學習方法,篩選出120個血漿游離CpG位點建立了一個胰腺癌疾病診斷分類器。在訓練隊列中,該分類器的陽性計數(shù)在胰腺癌患者中顯著高于對照組,且在早期(I&II期)和晚期(III&IV期)胰腺癌患者中均表現(xiàn)出優(yōu)異的診斷性能,AUC值達到0.99。在驗證隊列中,該診斷分類器的AUC值為 0.98,進一步證實了診斷性能的優(yōu)越性,且顯著優(yōu)于常規(guī)的胰腺癌診斷標記物CA19-9(AUC值為 0.87)。

在此基礎上,研究人員還開發(fā)了胰腺癌的甲基化評分和分型系統(tǒng),該系統(tǒng)不但能夠有效區(qū)分胰腺癌患者和對照組,還能根據(jù)評分對胰腺癌患者進行疾病分期。此外,通過生物信息學分析,研究人員還識別出數(shù)百個在胰腺癌與其他癌癥類型(如細胞性肝癌、結(jié)直腸癌胃癌)之間的差異甲基化CpG位點。采用這些差異化cfDNA標志物,可在血液中特異性地將胰腺癌與這幾種癌癥類型進行良好區(qū)分,因此,有望實現(xiàn)用一管血液樣本鑒別多種癌癥的無創(chuàng)篩查目標。

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圖2 胰腺癌細胞性肝癌、結(jié)直腸癌、胃癌的鑒別診斷。

該論文的第一作者為首都醫(yī)科大學附屬北京世紀壇醫(yī)院肝膽腫瘤外科的博士研究生胡文哲、主治醫(yī)師羅楠和北京大學第一醫(yī)院內(nèi)鏡中心的主治醫(yī)師趙旭東,通訊作者為彭吉潤教授和楊尹默教授。該研究得到了北京市衛(wèi)生健康委首都衛(wèi)生發(fā)展科研專項、國家自然科學基金、中國科協(xié)第九屆青年人才托舉工程項目的資助。

彭吉潤教授簡介

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彭吉潤,醫(yī)學博士、教授、主任醫(yī)師、博士研究生導師,首都醫(yī)科大學附屬北京世紀壇醫(yī)院肝膽腫瘤外科主任。擅長肝膽胰脾良惡性腫瘤的手術治療及免疫治療肝硬化門靜脈高壓癥的外科治療以及肝移植。近年主持國家自然科學基金、北京市自然科學金等多項課題,在Cell、Cancer Cell、Cell Research、Gut等國內(nèi)外核心期刊發(fā)表論文近百篇,并主譯第十九版《克氏外科學》。曾榮獲1994年度衛(wèi)生部科技進步三等獎,2007年度教育部科學技術獎一等獎、中華醫(yī)學科技獎二等獎,2008年度北京市科學技術獎二等獎以及2021年度北京市自然科學獎一等獎。

楊尹默教授簡介

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楊尹默,醫(yī)學博士、教授、主任醫(yī)師、博士研究生導師,北京大學第一醫(yī)院院長。擅長各種類型肝膽胰腺手術,執(zhí)筆撰寫多版《中國胰腺癌診療指南》。現(xiàn)任中華醫(yī)學會外科學分會胰腺學組副組長,美國外科學院會員(FACS),中國研究型醫(yī)院學會消化道腫瘤專業(yè)委員會副主任委員,中華醫(yī)學會外科學分會委員,中華普通外科雜志、中華肝膽外科雜志、中華消化外科雜志副主編,中國實用外科雜志、中華實驗外科、世界胃腸病學雜志、Langenbeck's Archives of Surgery雜志編委。曾獲2019年華夏醫(yī)學科技獎三等獎、2022年中國抗癌協(xié)會科技獎二等獎,榮獲“國之名醫(yī),卓越建樹”獎、“金柳葉刀獎”和北京市優(yōu)秀教師等稱號。

(薦稿:彭吉潤

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