?Frontiers in Oncology|彭吉潤、楊尹默課題組合作發(fā)表胰腺癌早期無創(chuàng)診斷新成果
3月10日,首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京世紀壇醫(yī)院肝膽腫瘤外科彭吉潤教授課題組與北京大學(xué)第一醫(yī)院楊尹默教授課題組合作,在國際期刊Frontiers in Oncology上發(fā)表了題為Circulating cell-free DNA methylation analysis of pancreatic cancer patients for early noninvasive diagnosis的研究論文,填補了胰腺癌早期篩查和診斷領(lǐng)域空白,有望造福更多臨床患者。
胰腺癌(PAC)是全球癌癥相關(guān)死亡的第七大原因,其早期癥狀隱匿且非特異,多數(shù)患者確診時已處于晚期,5年生存率僅為12%。目前,臨床上常用的胰腺癌診斷標志物CA19-9在疾病早期缺乏診斷敏感性和特異性。因此,迫切需要識別新的生物標志物或生物標志物組合,以解決胰腺癌早期篩查和診斷領(lǐng)域的空白。
該研究中,課題組收集了50例胰腺癌患者和52例健康對照者的血漿樣本,以及66例癌組織和配對正常胰腺組織樣本,采用甲基化CpG串聯(lián)擴增和測序(MCTA-Seq)方法對這些樣本進行檢測。MCTA-seq是彭吉潤教授課題組和北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心湯富酬教授、黃巖誼教授和文路副研究員等合作建立的一種高通量平臺,能夠在一次實驗中對數(shù)千個“CGCGCGG”型高甲基化CpG島進行檢測,突破了制約高通量甲基化組學(xué)分析的技術(shù)瓶頸,其檢測下限可低至1-2個細胞的基因組DNA,因此極大地提高了檢測的靈敏度和準確性。
通過分析,研究人員在胰腺癌組織中篩選出4615個差異甲基化CpG位點,并在胰腺癌患者血漿中篩選出1323個高甲基化和2619個低甲基化CpG位點。其中,一些生物標志物如IRX4、PRKCB和CLEC11A已被識別為胰腺癌的潛在診斷指標,而MMP2、NAT8L和GFRA4等則是本研究新發(fā)現(xiàn)的潛在生物標志物。
圖1 加和陽性法篩選胰腺癌診斷標志物,以及各個標志物在胰腺癌癌組織及配對正常組織中的差異表達情況。
從上述高甲基化CpG位點中,研究人員進一步采用機器學(xué)習(xí)方法,篩選出120個血漿游離CpG位點建立了一個胰腺癌疾病診斷分類器。在訓(xùn)練隊列中,該分類器的陽性計數(shù)在胰腺癌患者中顯著高于對照組,且在早期(I&II期)和晚期(III&IV期)胰腺癌患者中均表現(xiàn)出優(yōu)異的診斷性能,AUC值達到0.99。在驗證隊列中,該診斷分類器的AUC值為 0.98,進一步證實了診斷性能的優(yōu)越性,且顯著優(yōu)于常規(guī)的胰腺癌診斷標記物CA19-9(AUC值為 0.87)。
在此基礎(chǔ)上,研究人員還開發(fā)了胰腺癌的甲基化評分和分型系統(tǒng),該系統(tǒng)不但能夠有效區(qū)分胰腺癌患者和對照組,還能根據(jù)評分對胰腺癌患者進行疾病分期。此外,通過生物信息學(xué)分析,研究人員還識別出數(shù)百個在胰腺癌與其他癌癥類型(如肝細胞性肝癌、結(jié)直腸癌和胃癌)之間的差異甲基化CpG位點。采用這些差異化cfDNA標志物,可在血液中特異性地將胰腺癌與這幾種癌癥類型進行良好區(qū)分,因此,有望實現(xiàn)用一管血液樣本鑒別多種癌癥的無創(chuàng)篩查目標。
圖2 胰腺癌與肝細胞性肝癌、結(jié)直腸癌、胃癌的鑒別診斷。
該論文的第一作者為首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京世紀壇醫(yī)院肝膽腫瘤外科的博士研究生胡文哲、主治醫(yī)師羅楠和北京大學(xué)第一醫(yī)院內(nèi)鏡中心的主治醫(yī)師趙旭東,通訊作者為彭吉潤教授和楊尹默教授。該研究得到了北京市衛(wèi)生健康委首都衛(wèi)生發(fā)展科研專項、國家自然科學(xué)基金、中國科協(xié)第九屆青年人才托舉工程項目的資助。
彭吉潤教授簡介
彭吉潤,醫(yī)學(xué)博士、教授、主任醫(yī)師、博士研究生導(dǎo)師,首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京世紀壇醫(yī)院肝膽腫瘤外科主任。擅長肝膽胰脾良惡性腫瘤的手術(shù)治療及免疫治療,肝硬化門靜脈高壓癥的外科治療以及肝移植。近年主持國家自然科學(xué)基金、北京市自然科學(xué)金等多項課題,在Cell、Cancer Cell、Cell Research、Gut等國內(nèi)外核心期刊發(fā)表論文近百篇,并主譯第十九版《克氏外科學(xué)》。曾榮獲1994年度衛(wèi)生部科技進步三等獎,2007年度教育部科學(xué)技術(shù)獎一等獎、中華醫(yī)學(xué)科技獎二等獎,2008年度北京市科學(xué)技術(shù)獎二等獎以及2021年度北京市自然科學(xué)獎一等獎。
楊尹默教授簡介
楊尹默,醫(yī)學(xué)博士、教授、主任醫(yī)師、博士研究生導(dǎo)師,北京大學(xué)第一醫(yī)院院長。擅長各種類型肝膽胰腺手術(shù),執(zhí)筆撰寫多版《中國胰腺癌診療指南》?,F(xiàn)任中華醫(yī)學(xué)會外科學(xué)分會胰腺學(xué)組副組長,美國外科學(xué)院會員(FACS),中國研究型醫(yī)院學(xué)會消化道腫瘤專業(yè)委員會副主任委員,中華醫(yī)學(xué)會外科學(xué)分會委員,中華普通外科雜志、中華肝膽外科雜志、中華消化外科雜志副主編,中國實用外科雜志、中華實驗外科、世界胃腸病學(xué)雜志、Langenbeck's Archives of Surgery雜志編委。曾獲2019年華夏醫(yī)學(xué)科技獎三等獎、2022年中國抗癌協(xié)會科技獎二等獎,榮獲“國之名醫(yī),卓越建樹”獎、“金柳葉刀獎”和北京市優(yōu)秀教師等稱號。
(薦稿:彭吉潤)
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- 肝膽胰外科
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